世界观焦点:柴胡皂苷生物中,β-香树脂素合酶BcBAS1的基因对植物代谢的影响
柴胡皂甙是一种常用的中药植物,柴胡皂甙(SSs)是柴胡中主要的活性齐墩果烷型三萜皂甙。β-香树脂醇合成酶(β-AS)是齐墩果烷型三萜皂苷合成中的重要酶类,但其在柴胡皂苷合成中的作用鲜有研究。
【资料图】
根据代谢组学和转录组学分析选择推定的β-AS基因BcBAS1被克隆,通过在大肠杆菌和毕赤酵母中的异源表达进行功能表征,检查了其亚细胞定位和表达模式。BcBAS1重组蛋白的分子量约为87kDa,该蛋白可催化SSs前体β-香树素的产生。
此外,BcBAS1位于胞质溶胶中,四种基因型的四种组织中的相对表达与SSa和SSd含量呈正相关。我们的结果表明BcBAS1是一个β-AS基因,可能在柴胡皂苷的生物合成和调控中发挥重要作用。这项研究阐明了β-AS基因在SS合成中的作用,并为SS的代谢工程提供了见解。
三萜皂苷和三萜类化合物作为植物次生代谢产物,是许多植物中含量最丰富的天然产物。三萜类化合物的生物合成依赖于类异戊二烯途径(Mosesetal. 2014 )。三萜类化合物的生物合成始于2,3-氧化鲨烯和2,3-氧化鲨烯在氧化鲨烯环化酶(OSC)的催化下环化成不同形式的三萜骨架。
三萜骨架被细胞色素P450酶(P450s)羟基化或氧化,最后被尿苷二磷酸糖基转移酶(UGT)糖基化,从而产生不同的三萜皂苷。
OSCs被广泛认为在不同类型三萜皂苷的产生中起着至关重要的作用,它们也被定义为调节不同三萜皂苷合成的重要分支点。β-AS是OSC家族的成员,负责产生齐墩果酸皂苷骨架。
目前,超过1600条β-AS序列已在GenBank数据库中注册,其中许多已在许多植物物种中被克隆和功能表征(Maetal.2018b )。然而,关于柴胡属植物中β-AS基因的研究很少。只有两个β-AS基因,称为bcAS1(Gaoetal. 2015 )和BcBAS(Lietal.2015)。2020 ),具有来自B.chinense DC.的完全克隆序列,BcBAS已在酿酒酵母中进一步表达以分析其功能。
此外,β-AS在不同基因型白蛉DC中的亚细胞定位和表达模式。目前还不清楚。因此,有必要研究β-AS基因在柴胡植物中的克隆、表征、亚细胞定位和表达模式。
在我们之前的研究中,通过代谢组和转录组的综合分析鉴定了24个β-ASunigenes。这24个β-ASunigenes可能代表了BLAST选择的四种非冗余β-AS(BcBAS1、BcBAS2、BcBAS3和BcBAS4),并且Bc61215(BcBAS1)与SSd和SSb显着相关。
在这项研究中,我们获得了BcBAS1的全长序列,并在大肠杆菌中表达了它。还研究了拟南芥叶原生质体中的亚细胞定位和使用毕赤酵母GS115中的异源表达系统推断的功能。
我们进一步探讨了BcBAS1在四种基因型中的表达模式,首次分析了该基因的表达量与SSs含量的相关性。结果表明,BcBAS1是β-AS基因,仅催化β-香树脂素的形成。BcBAS1可能是合成SS的关键酶,我们的研究可能为SS的代谢工程提供见解。
的植株材料为白蔹 DC.的4个基因型,即CBC1、CBC3、RX和FS。于2020年7月在盛花期采集,所有样品立即用液氮冷冻,并储存在-80°C直至进一步使用。
RNA分离、cDNA合成和基因克隆
从四种基因型的白蛉DC的不同组织中,提取总RNA ,根据制造商的说明使用RNAPrepPurePlantKit,对3株个体植物的混合样品进行每次RNA提取。
按照制造商的说明,使用一体式第一链cDNA合成SuperMix(TransScript,中国)从1000ng总RNA合成第一链cDNA,全长BcBAS1序列取自B.chinense DC。
转录组文库,包括来自四种不同组织(根、叶、茎和花),总共93486个unigenes(Heetal. 2021). 利用ORFFinder定位BcBAS1的开放阅读框(ORF),根据其全长序列,利用Primer5.0软件设计扩增BcBAS1的特异性引物。
为了进一步研究BcBAS1的生物学作用,我们分析了在拟南芥叶的原生质体中用绿色荧光蛋白(GFP)融合瞬时表达的BcBAS1的亚细胞定位,并通过共聚焦显微镜观察它们。
BcBAS1基因的融合表达载体是使用特异性引物对构建的,将该片段插入pBI221-GFP载体以生成pBI221-GFP-βAS融合蛋白。含有与红色荧光蛋白mCherryORF融合的拟南芥,H+-ATPase质膜信号蛋白片段的pBI221-PM-mCherry载体,被用作膜定位控制标记.,所有荧光图像,包括GFP和mCherry信号,均使用激光扫描共聚焦显微镜进行可视化。
GFP的激发和发射波长分别为488nm和510–550nm,mCherry的激发和发射波长分别为587nm和610–650nm。
序列和系统发育分析
为了了解BcBAS与其他植物OSC的进化关系,我们将它们的氨基酸序列与其他报道的具有已知功能的OSC的氨基酸序列进行了比较。
系统发育分析结果,根据它们的序列将这些基因分为第一组和第二组。BcBASs都聚集在第一组,即单功能β-AS基因组,β-香树素是主要化合物。第II组包含产生α-香树素和β-香树素的多功能酶,以及其他化合物,例如δ-香树素、羽扇豆醇、蒲公英甾醇、Ψ-蒲公英甾醇和达马烯二醇-II。
此外,BcBAS3与CrAS和OEA基因聚类,可产生α-香树脂素和β-香树脂素。BcBAS2与PNY1聚类最紧密,BcBAS4与AaBAS、TkASC6和AsOXA1归为一组,这些基因被表征为只能产生β-香树脂素的单功能β-ASs。BcBAS1与其他BcBAS不同;它聚集在组I中,但与其他组并不接近。这些结果表明BcBAS2和BcBAS4可能是单功能的β-ASs,
我们根据转录组序列设计特异性引物,得到的BcBAS1全长2498bp,ORF为2289bp,编码762个氨基酸的蛋白质,分子量约为87kDa,理论等电点(pI)为5.92。发现BcBAS1与β-ASs具有很高的相似性;它与B.chinense DC的β-AS具有98.60%的序列相似性。(HQ166837.1)与柴胡(AY514455.1)、胡萝卜中的β-AS具有97.86%、85.66%和84.00%的相似性。
此外,比对分析(图 2)中柴胡(Lietal. 2020 )、拟南芥(Kolesnikovaetal. 2007 )、人参(Kushiroetal. 1998 )和甘草(Hayashietal. 2001 )中BcBAS1氨基酸序列的保守区域显示BcBAS1表现出OSC基因的典型保守区域,与其他区域相似。
BcBAS1不仅包含DCTAE基序,被认为是底物结合基序,在真核OSC中高度保守,但也有一个MWCYCR基序,这是β-ASs的特征基序。此外,它拥有4个QW基序,可能在加强酶的结构和稳定其碳阳离子中间体方面发挥作用。
BcBAS1的亚细胞定位
蛋白质亚细胞定位的在线预测显示BcBAS1可能存在于胞质溶胶中。为了确认BcBAS1的预测定位,我们构建了一个pBI221-GFP-βAS载体,并在拟南芥原生质体中瞬时表达质粒,以及与mCherry融合的H+-ATPase蛋白。
原生质体边缘有明显的绿色荧光。BcBAS1-GFP信号与单独的GFP信号相似,没有与红色荧光蛋白mCherry信号重叠,表明BcBAS1确实是一个定位于胞质溶胶的基因,这与预测一致。
为表达BcBAS1融合蛋白,构建重组载体pET28a-βAS并测序验证。将重组载体pET28a-βAS转化大肠杆菌BL21(DE3),IPTG37℃诱导4小时,25℃诱导8小时,16℃诱导16小时。
SDS-PAGE分析显示,25°C8小时和16°C16小时导致融合蛋白成功表达,预期大小约为87kDa,这在阴性对照中未显示。重组蛋白以包涵体形式表达,16℃16h是融合蛋白诱导的最佳条件。
BcBAS1的表达分析
为了深入了解BcBAS1基因的表达模式,我们对B.chinense DC.的四种基因型进行了qRT-PCR,包括根、叶、花和茎四种组织。BcBAS1在4个基因型的所有组织中均有表达,其在根部的表达量显着高于4个基因型的其他组织,CBC1、CBC3和RX茎中的表达量最低,而花在FS中的表达水平最低。
BcBAS1转录水平在根中比在CBC3的茎中高121.7倍,而在RX、FS和CBC1中分别高92.3、53.6和12.6倍,分别。根中最高的转录水平表明根可能是柴胡皂苷合成的主要场所。B.chinense DC..此外,BcBAS1的表达水平和模式在四种基因型之间表现出较大差异,这可能是基因型本身差异的结果。
BcBAS1基因表达与柴胡皂苷含量的相关性
为了研究BcBAS1基因表达水平与SSs含量之间的关系(Heetal. 2021 ),使用IBMSPSSStatistics20.0进行了Pearson相关分析。BcBAS1的表达与4个基因型的SSa和SSd呈正相关。
并且与CBC3叶片中的SSa和SSd呈极显着正相关(p<0.01)。BcBAS1表达与FS叶片中的SSd也呈显着正相关(p<0.05),其他相关性无统计学意义(p<0.05)。
基于分析,我们推测BcBAS1基因的表达水平影响了SSs的含量。BcBAS1基因可能在SS的合成中发挥重要作用,BcBAS1基因表达的增加可能导致SS及其前体的产生增加。
结论
在这项研究中,一个名为BcBAS1的SSs通路基因来自B.chinense DC。使用异源表达系统在大肠杆菌 和巴斯德毕赤酵母中成功克隆和表征。
我们的结果表明,BcBAS1的重组蛋白大小约为87kDa。BcBAS1是β-AS基因,β-香树脂是毕赤酵母唯一的发酵产物表达BcBAS1。BcBAS1位于细胞质中,这与我们的预测一致。此外,BcBAS1的表达水平与SS的内容密切相关。四种基因型的根中BcBAS1表达水平最高,BcBAS1可能参与SSs的生物合成和调控。
然而,BcBAS1的功能还需要进一步探索,P450s和UTGs在SSs生物合成中的协同调节也需要在未来进行研究。该工作的结果进一步揭示了SSs的生物合成途径,可能有助于进一步研究SSs的生物合成和调控,为今后SSs的代谢工程奠定基础。
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